RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ARV1Q9H2C2 271 aa15.77■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 CELA3AP09093 270 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NFYBP25208 207 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 MIDNQ504T8 468 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NEK7Q8TDX7 302 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TCEAL3Q969E4 200 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ABI3Q9P2A4 366 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PRH1P02810 166 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 DANCRP0C864 163 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 CAMLGP49069 296 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 FGF12P61328 243 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 Q8NFD4 153 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 GINS3Q9BRX5 216 aa15.76■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 WFDC1Q9HC57 220 aa15.76■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNHIT1O43257 154 aa15.75■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NME2P1O60361 137 aa15.75■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SPP1P10451 314 aa15.75■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF695Q8IW36 515 aa15.75■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.75■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HSPB6O14558 160 aa15.74■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 CDS2O95674 445 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HEXAP06865 529 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PEA15Q15121 130 aa15.74■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 DDA1Q9BW61 102 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HES7Q9BYE0 225 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 KPTNQ9Y664 436 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF732B4DXR9 585 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 C9JQL5 133 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS44E7EML9 344 aa15.74■□□□□ 0.11
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SYNE4-204ENST00000465425 MKXQ8IYA7 352 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 COMMD1Q8N668 190 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 Q9N2K0 584 aa15.74■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TRDCB7Z8K6 153 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 COX5BP10606 129 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ITGA3P26006 1051 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SNCAP37840 140 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 RAB5CP51148 216 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZXDAP98168 799 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 OR1C1Q15619 314 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 HMGN3Q15651 99 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 APH1AQ96BI3 265 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SPIN2AQ99865 258 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF175Q9Y473 711 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SCTP09683 121 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 RAB1AP62820 205 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 MPV17LQ2QL34 196 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PCSK5Q92824 1860 aa15.73■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf172C9J069 976 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 FAM157AC9JC47 383 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 NAPSAO96009 420 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 KIR2DS4P43632 304 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 FHITP49789 147 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 RAB13P51153 203 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PLGLB1Q02325 96 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 PLP2Q04941 152 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 KIR2DS1Q14954 304 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.72■□□□□ 0.11
SYNE4-204ENST00000465425 OR2C3Q8N628 320 aa15.72■□□□□ 0.11
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