RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
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PRAME-209ENST00000439106 PTGFRP43088 359 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 RSU1Q15404 277 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 ELP2Q6IA86 826 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZS46 218 aa11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 CHST4Q8NCG5 386 aa11.14□□□□□ -0.63
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