RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	SERPINB7	O75635	380 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TGDS	O95455	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SNAP29	O95721	258 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV2D-28	P01615	120 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV1-46	P01743	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CCL2	P13500	99 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IDO1	P14902	403 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ETS2	P15036	469 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	STOM	P27105	288 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CDKN2C	P42773	168 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CAV2	P51636	162 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BID	P55957	195 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BPIFB3	P59826	476 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PCBD1	P61457	104 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GLO1	Q04760	184 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FADD	Q13158	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	STX3	Q13277	289 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	REEP3	Q6NUK4	255 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SKA3	Q8IX90	412 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8H2	Q8N162	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF561	Q8N587	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5J2	Q8NH18	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ITCH	Q96J02	903 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF75A	Q96N20	296 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF607	Q96SK3	696 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SH3GL3	Q99963	347 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SIAE	Q9HAT2	523 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NPTN	Q9Y639	398 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	DYSF	O75923	2080 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	VWF	P04275	2813 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0B4J2E0	115 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1B0GX12	115 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GMNC	A6NCL1	334 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC30	A6NM36	301 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CENPBD1	B2RD01	187 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283		H3BSA7	217 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TM9SF1	O15321	606 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FMO6P	O60774	539 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ERLIN1	O75477	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MMP23A	O75900	390 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GLCE	O94923	617 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MFN2	O95140	757 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BGLAP	P02818	100 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CD55	P08174	381 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GSTM3	P21266	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TUBG1	P23258	451 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OMG	P23515	440 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IL12A	P29459	219 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SAA4	P35542	130 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RAG2	P55895	527 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ERVS71-1	P61550	626 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RGN	Q15493	299 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1Q1	Q15612	314 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TTMP	Q5BVD1	217 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	THEM4	Q5T1C6	240 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR157	Q5UAW9	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	HHAT	Q5VTY9	493 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC18	Q8N456	261 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CORO2A	Q92828	525 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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