RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SHISA3A0PJX4 238 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PITX3O75364 302 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CNIH1O95406 144 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ACTL6AO96019 429 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RND3P61587 244 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MGAT2Q10469 447 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 Q5PR19 223 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZNB5 142 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GAPTQ8N292 157 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR4C12Q96R67 309 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR5B21A6NL26 309 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CDS2O95674 445 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 APCSP02743 223 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RTL8BQ17RB0 113 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BADQ92934 168 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 AQP10Q96PS8 301 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 STARD10Q9Y365 291 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CEACAM5P06731 702 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CT62P0C5K7 136 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ADPRHP54922 357 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR1D5P58170 312 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SLC35B1P78383 322 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TEX30Q5JUR7 227 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 GPR27Q9NS67 375 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 BCORQ6W2J9 1755 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TRDCB7Z8K6 153 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PDE6DO43924 150 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CXCL13O43927 109 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PPYP01298 95 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ADH4P08319 380 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 G6PCP35575 357 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HERPUD1Q15011 391 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CD226Q15762 336 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF77Q15935 545 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 C8orf44Q96CB5 159 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FAM157BP0CG42 384 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 LIMS1P48059 325 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OR2M7Q8NG81 312 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FCGR3BO75015 233 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 KIR3DL2P43630 455 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HOGA1Q86XE5 327 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RSG1Q9BU20 258 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF11O14788 317 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HOXA5P20719 270 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 GLIPR1P48060 266 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 EFNB1P98172 346 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SSX8Q7RTT4 187 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FGF14Q92915 247 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RNF2Q99496 336 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RREB1Q92766 1687 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SCN1AP35498 2009 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PLPP3O14495 311 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CTSVO60911 334 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PRSS1P07477 247 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TMEM50BP56557 158 aa8.63□□□□□ -1.03
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