RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCD5O14737 125 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A1O15245 554 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBP4P02753 201 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A15PP0C7V4 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A13PP0C7W8 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A14PP0C7W9 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A24PP0C7X0 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINA2P20848 420 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYL9P24844 172 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTR2CP28335 458 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR3A1P47881 315 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDDM3BP56851 147 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAX5Q02548 391 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEDD8Q15843 81 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR157Q5UAW9 335 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10K1Q8NGX5 313 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCGF1Q9BSM1 259 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSR3Q9UNL2 185 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTORP42345 2549 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0A6YYJ9 748 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC17A2O00624 439 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRTN3P24158 256 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P2RX3P56373 397 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGYQ3MUY2 71 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP43Q70EL4 1123 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBX15Q96SF7 602 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA1O95477 2261 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BPNT1O95861 308 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGMTP16455 207 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFPP27918 469 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN1BQ07699 218 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDDM3AQ14507 147 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N7P7 452 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNG3Q8TAE7 436 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUCNR1Q9BXA5 334 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHST6Q9GZX3 395 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 V9GY05 133 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FN1P02751 2386 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV24A0A0B4J272 114 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLAP06280 429 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF728P0DKX0 622 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD36P16671 472 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C22orf42Q6IC83 251 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPRA1Q86W33 373 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BPIFB2Q8N4F0 458 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CORO2AQ92828 525 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF714Q96N38 554 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BARHL1Q9BZE3 327 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPA2Q9H2U2 334 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLGRKTQ9HBL7 147 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PP11 408 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf98A8MV24 154 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCF21O43680 179 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-69P01742 117 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VSIG8P0DPA2 414 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARSBP15848 533 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB3BP20337 219 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVFRD-1P60508 538 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF273Q14593 569 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB11BQ15907 218 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF9Q16594 264 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRBOX4Q5JUW0 171 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRIMA1Q86XR5 153 aa12.55□□□□□ -0.4
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