RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A31Q9H0C2 315 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RMND1Q9NWS8 449 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAGKQ9UJ70 344 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTBP4Q8N2S1 1624 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSH2Q76I76 1423 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNIKQ9UKE5 1360 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB19A4D1S5 217 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGPA6NDG6 321 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NED7 52 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MWP4 228 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BMM0 161 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0QXV9 152 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC31A1O15431 190 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSCAO43653 123 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPOPO43791 374 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYO1DO94832 1006 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDS2O95674 445 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC172P0C7W6 258 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSNL1P62760 191 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPBGQ13641 420 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNXAQ16473 311 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 HBMQ6B0K9 141 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLYATQ6IB77 296 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAIR2Q6ISS4 152 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSX6Q7RTT6 188 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LYPD6Q86Y78 171 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPICQ8N5J4 248 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2M3Q8NG83 312 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4K17Q8NGC6 315 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC20Q8TCA0 184 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASTOR1Q8WTX7 329 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2WQ96B02 151 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01587Q99440 93 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMACHCQ9Y4U1 282 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 FADS3Q9Y5Q0 445 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 U3KQK5 164 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDHAF1A6NFY7 115 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_2039718K7EN88 272 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMD11O00231 422 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBDO15205 165 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMPSTE24O75844 475 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR75O95800 540 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100A9P06702 114 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSGP08311 255 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC2A1P11166 492 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTFRP26992 372 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100A2P29034 98 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN5P62079 268 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 XIAPP98170 497 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS2Q13268 280 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPPEQ6ZT21 453 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH3Q86UD3 253 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIML2Q8N7C3 387 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5P3Q8WZ94 311 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC39Q96DD0 335 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSANTD3Q96H12 275 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 OLFM3Q96PB7 478 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PITX2Q99697 317 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUCNR1Q9BXA5 334 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB1BQ9H0U4 201 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLPH3Q9H4A6 298 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNA1GO43497 2377 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRC5Q86WI3 1866 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GU33 70 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA8IPA6NC78 632 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 I3L4J1 428 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCF21O43680 179 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCD6O75340 191 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 POP7O75817 140 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDYNP01213 254 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GUSBP08236 651 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CGB3P0DN86 165 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CGB7P0DN87 165 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBR1P16152 277 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYCR1P32322 319 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2H1P32780 548 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2KP61086 200 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNNC1P63316 161 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 HBG1P69891 147 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 HBG2P69892 147 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAXQ07812 192 aa1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms