RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRV1 198 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 K7N7A8 449 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF737O75373 536 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CHRM2P08172 466 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CCL3L1P16619 93 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CPEP16870 476 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 BCL3P20749 454 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GALP22466 123 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 BDKRB2P30411 391 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GABRA5P31644 462 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SOX2P48431 317 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD7P51665 324 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GPR176Q14439 515 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF273Q14593 569 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KISS1Q15726 138 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TAF9Q16594 264 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MIDNQ504T8 468 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HCP5Q6MZN7 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF529Q6P280 563 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR8H2Q8N162 312 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR5R1Q8NH85 324 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SGCDQ92629 289 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RFT1Q96AA3 541 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MGLLQ99685 303 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM82A0PJX8 343 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CCRL2O00421 344 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HAND1O96004 215 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LALBAP00709 142 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PRKACAP17612 351 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GABRR1P24046 479 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 COX7A1P24310 79 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TGFBR2P37173 567 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 NPBWR2P48146 333 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DLX6P56179 175 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EDDM3BP56851 147 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ERVFRD-1P60508 538 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EDDM3AQ14507 147 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PRR31Q5SQ13 230 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DDI2Q5TDH0 399 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 XAF1Q6GPH4 301 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PXT1Q8NFP0 134 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf50Q8WW18 174 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DERL3Q96Q80 235 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SPACA5Q96QH8 159 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR14A2Q96R54 314 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR5M11Q96RB7 305 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TMED9Q9BVK6 235 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CHST6Q9GZX3 395 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GHRLQ9UBU3 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FUOMA2VDF0 154 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf98A8MV24 154 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 H3BUX3 64 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SIRPB1O00241 398 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KDM4BO94953 1096 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RBP4P02753 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UBBP0CG47 229 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF728P0DKX0 622 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM225BP0DP42 221 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CALCBP10092 127 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB9P28065 219 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP1P28562 367 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PTGFRP43088 359 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MTNR1BP49286 362 aa6.23□□□□□ -1.41
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