RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ERGIC1Q969X5 290 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CLDN23Q96B33 292 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CACNG5Q9UF02 275 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ADGRG7Q96K78 797 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 COL4A6Q14031 1691 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PNV4 684 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 IP6K3Q96PC2 410 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR10P1Q8NGE3 313 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 HTD2P86397 168 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MPV17LQ2QL34 196 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FAM166AQ6J272 317 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RAB40CQ96S21 281 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FOSL2P15408 326 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 SELENOVP59797 346 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 EDDM3AQ14507 147 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HFEQ30201 348 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-CQ95604 372 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YW62 118 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ARR3P36575 388 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR51I2Q9H344 312 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GPR27Q9NS67 375 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TRDCB7Z8K6 153 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TERTO14746 1132 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM27BQ5VT28 67 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 GPHA2Q96T91 129 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM100Q9NV29 134 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SNCAP37840 140 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR10AD1Q8NGE0 317 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FGF16O43320 207 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CST2P09228 141 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM252Q8N6L7 170 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR4A4PQ8NGN8 299 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SH2D1BO14796 132 aa13.53□□□□□ -0.24
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