RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 BTF3L4Q96K17 158 aa8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 VAX2Q9UIW0 290 aa8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.9□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 RER1O15258 196 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 LINC00614P0C842 121 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 BCL2P10415 239 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 KRTDAPP60985 99 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 HIST1H3AP68431 136 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ARL6IP1Q15041 203 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CST6Q15828 149 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SGCBQ16585 318 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 C2orf27AQ580R0 203 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 FAM78BQ5VT40 261 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 MMDQ15546 238 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF77Q15935 545 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR4F5Q8NH21 305 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR4F4Q96R69 305 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 APOOQ9BUR5 198 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 RBKSQ9H477 322 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PRSS38A1L453 326 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SHISA7A6NL88 538 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR2J2O76002 312 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 POU2F2P09086 479 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 GZMHP20718 246 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CCKARP32238 428 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CEACAM6P40199 344 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM187Q14656 261 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 LHX4Q969G2 390 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ARV1Q9H2C2 271 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 GLRX2Q9NS18 164 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.89□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ISG15P05161 165 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CISD3P0C7P0 127 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PGCP20142 388 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 BRS3P32247 399 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 DRD3P35462 400 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CLRN1P58418 232 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 BPIFB3P59826 476 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 KIR2DS3Q14952 304 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 HLA-CQ95604 372 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 VSIRQ9H7M9 311 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 FAM60AQ9NP50 221 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 RPRMQ9NS64 109 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 FAM206AQ9NX38 181 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 HSPB6O14558 160 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CHST1O43916 411 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 IAPPP10997 89 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PLA2G5P39877 138 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CLDN17P56750 224 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR5AS1Q8N127 324 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 SZT2Q5T011 3432 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 B4E171 279 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 IFNA1P01562 189 aa8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CLDN1-201ENST00000295522 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms