RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 DTD1Q8TEA8 209 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIAL4EA0A075B759 164 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIAL4DF5H284 164 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PNPP00491 289 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 IGFBP7Q16270 282 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GAB4Q2WGN9 574 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CMPK2Q5EBM0 449 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 HCP5Q6MZN7 132 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0B4J2E0 115 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GX12 115 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PTP4A1Q93096 173 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PRSS1P07477 247 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 UCNP55089 124 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LCN2P80188 198 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00303Q3SY05 128 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TM4SF20Q53R12 229 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GATA6Q92908 595 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 C16orf92Q96LL3 132 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GDF9O60383 454 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GABRB1P18505 474 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ASB5Q8WWX0 329 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 S4R3C0 116 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 DYNLT3P51808 116 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 NUBP1P53384 320 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 HGDQ93099 445 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MED30Q96HR3 178 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAUP00749 431 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 DDOSTP39656 456 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF826PQ6ZT77 177 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8G5Q8NG78 346 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2V2Q96R30 315 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CBY3A6NI87 242 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 AREGP15514 252 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MESP2Q0VG99 397 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MRGPRGQ86SM5 289 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4X1Q8NH49 305 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR35Q9HC97 309 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM129A0AVI4 362 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CLDN14O95500 239 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GCSHP23434 173 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TAS2R60P59551 318 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC20Q12834 499 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8WTZ3 238 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PP6455Q8WZ26 134 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 U3KQ87 197 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMB1P07942 1786 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 FCARP24071 287 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ERVS71-1P61550 626 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC88CQ9P219 2028 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 OOEPA6NGQ2 149 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PSG5Q15238 335 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 DIRC2Q96SL1 478 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP5SQ99766 215 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 GALR1P47211 349 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MMP15P51511 669 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 RAC3P60763 192 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 CES1P1Q9UKY3 287 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ACSM4P0C7M7 580 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF738Q8NE65 137 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms