RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 PRH1P02810 166 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 OTX2P32243 289 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 RND3P61587 244 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 PDCD1Q15116 288 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ACER2Q5QJU3 275 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SAXO1Q8IYX7 474 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TMEM56Q96MV1 263 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SPIN2AQ99865 258 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 PBDC1Q9BVG4 233 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 C11orf1Q9H5F2 150 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TUBA4BQ9H853 241 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 B4E171 279 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 GDF1P27539 372 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN7P41732 249 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 GFRA1P56159 465 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 RNF212Q495C1 297 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ABHD3Q8WU67 409 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 EXTL1Q92935 676 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 C14orf79Q96F83 325 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ABHD14BQ96IU4 210 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 RPS10P5Q9NQ39 176 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TCFL5Q9UL49 500 aa24.11■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 PCP4L1A6NKN8 68 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 NPBWR2P48146 333 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 IGSF11Q5DX21 431 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 OR2C3Q8N628 320 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 CLCC1Q96S66 551 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SH3BGRL3Q9H299 93 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 DEPPQ9NTK1 212 aa24.1■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 LINC01387J3KSC0 135 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 GNRHRP30968 328 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ3P48549 501 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 C12orf57Q99622 126 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 LINC00470Q9BZP3 86 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GW64 132 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 PTAFRP25105 342 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 CYB561P49447 251 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ZNF266Q14584 549 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 AWAT1Q58HT5 328 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 C2CD4CQ8TF44 421 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SFT2D1Q8WV19 159 aa24.09■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 TK1P04183 234 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 FHITP49789 147 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 RPS18P62269 152 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SPACA1Q9HBV2 294 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 Q9N2K0 584 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A10Q9NS82 523 aa24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UBP1-201ENST00000283628 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-6A6NCS4 301 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 MT-ND4LP03901 98 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 ZFP82Q8N141 532 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BAQ96A08 127 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SMDT1Q9H4I9 107 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 CFAP54Q96N23 3096 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SHANK1Q9Y566 2161 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 NAPSAO96009 420 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 FGF12P61328 243 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 FOXO1Q12778 655 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 AKIRIN2Q53H80 203 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 ETV3LQ6ZN32 361 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D26Q86UD7 250 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 ZNF695Q8IW36 515 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 ZNF565Q8N9K5 539 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A7Q92504 469 aa24.07■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 C7orf77A4D0Y5 90 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 C1orf196B1AJZ1 125 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 K7N7A8 449 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 PITX3O75364 302 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SERPINA7P05543 415 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 DCAF12Q5T6F0 453 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 OR56B2PQ8NGI1 322 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SLC35B3Q9H1N7 401 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 BCL3P20749 454 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SSPNQ14714 243 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A31Q9H0C2 315 aa24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 C1QL1O75973 258 aa24.05■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 PRDX4Q13162 271 aa24.05■■□□□ 1.44
UBP1-201ENST00000283628 MPV17LQ2QL34 196 aa24.05■■□□□ 1.44
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