RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 HTR2CP28335 458 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CX3CR1P49238 355 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 LSM6P62312 80 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CYCSP99999 105 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 GAMTQ14353 236 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf135Q5VTT2 229 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 UBAC2Q8NBM4 344 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 POMT1Q9Y6A1 747 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZGRF1Q86YA3 2104 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SULT1A2P50226 295 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ROM1Q03395 351 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 RSU1Q15404 277 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 VWA1Q6PCB0 445 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC9AQ6UXN8 241 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF679Q8IYX0 411 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC22Q8N966 263 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR51A2Q8NGJ7 313 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ASB5Q8WWX0 329 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PARP11Q9NR21 331 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PRRG2O14669 202 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FAM27BQ5VT28 67 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FDX2Q6P4F2 183 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 GVQW1Q8N7I0 195 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR10S1Q8NGN2 331 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CD300LFQ8TDQ1 290 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLC5A7Q9GZV3 580 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 AMDHD2Q9Y303 409 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 EDN3P14138 238 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A6Q4U2R8 563 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FBXW9Q5XUX1 488 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS54Q6PEW0 395 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 C1QL4Q86Z23 238 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 NAXEQ8NCW5 288 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A8Q9NY64 477 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CKLFQ9UBR5 152 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 HSPB2A8KAH6 182 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 RER1O15258 196 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ADAP1O75689 374 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SPOCK1Q08629 439 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 HSPB2Q16082 182 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR51F2Q8NH61 342 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 MISP3Q96FF7 219 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 DOK5Q9P104 306 aa17.55■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TNFSF13O75888 250 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN15O95858 294 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ARF1P84077 181 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PDZD11Q5EBL8 140 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL24Q6TFL4 600 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A24Q8N4F4 322 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 JAGN1Q8N5M9 183 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ACBD4Q8NC06 268 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR1J1Q8NGS3 322 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 RNF133Q8WVZ7 376 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 THRSPQ92748 146 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLAMF6Q96DU3 332 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 AQP10Q96PS8 301 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PRR13Q9NZ81 148 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 LRP12Q9Y561 859 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 USP24Q9UPU5 2620 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ARID1AO14497 2285 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 UMAD1C9J7I0 102 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FAHD2AQ96GK7 314 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GWJ7 208 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TSTD3H0UI37 97 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TCAPO15273 167 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TIMP3P35625 211 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PKIAP61925 76 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FJX1Q86VR8 437 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CENPMQ9NSP4 180 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 OR2C1O95371 312 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 HRH1P35367 487 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 SUCNR1Q9BXA5 334 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CSTBP04080 98 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 CST2P09228 141 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 GLI4P10075 376 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 RHEBQ15382 184 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 GUK1Q16774 197 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
UBE2B-201ENST00000265339 FOXRED2Q8IWF2 684 aa17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms