RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 LPAR6P43657 344 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 FGF12P61328 243 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RND3P61587 244 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 AWAT1Q58HT5 328 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BIVMQ86UB2 503 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PRR18Q8N4B5 295 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SLC35G3Q8N808 338 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LYZL4Q96KX0 146 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LPE4 126 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPZ6 126 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 B4DEV8 164 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SMIM6P0DI80 62 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BCL3P20749 454 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CYTIPO60759 359 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MT-CO2P00403 227 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HEXAP06865 529 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PSMB3P49720 205 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SELENOVP59797 346 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR1C1Q15619 314 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR51H1Q8NH63 302 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 FAM117AQ9C073 453 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KCNAB3O43448 404 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZIC3O60481 467 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NPBWR1P48145 328 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CSRP2Q16527 193 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF787Q6DD87 383 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF429Q86V71 674 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LRTM2Q8N967 370 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TAAR6Q96RI8 345 aa7.68□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 H0Y980 276 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RAMP1O60894 148 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CLDN1O95832 211 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GLI4P10075 376 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CCL4P13236 92 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SNCAP37840 140 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HAGHQ16775 308 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SHEQ5VZ18 495 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR2A2Q6IF42 318 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BTNL8Q6UX41 500 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MYO9BQ13459 2157 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1CQ13936 2221 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C21orf140B9A014 251 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ACTL6AO96019 429 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRB3P79483 266 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF92Q03936 586 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RAB31Q13636 194 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1FQ16864 119 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RDH5Q92781 318 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF524Q96C55 264 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 H0YIZ8 118 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 FAM219AQ8IW50 185 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MALSU1Q96EH3 234 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MSGN1A6NI15 193 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CELA2AP08217 269 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 DYNLT3P51808 116 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GAPTQ8N292 157 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RNF138Q8WVD3 245 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RAB39BQ96DA2 213 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C18orf12Q96KH6 178 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SOX7Q9BT81 388 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR51B6Q9H340 312 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GLRX2Q9NS18 164 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1456Q9P272 454 aa7.67□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms