RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 COMMD9Q9P000 198 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MLNRO43193 412 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ADAP1O75689 374 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 GRPP07492 148 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBG1P23258 451 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 S100A11P31949 105 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 FXYD4P59646 89 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ERVK11-1P61568 191 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RHOFQ9HBH0 211 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF83P51522 516 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 Q6P435 159 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF546Q86UE3 836 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MFFQ9GZY8 342 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RAB18Q9NP72 206 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RDH8Q9NYR8 311 aa20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13-201ENST00000262067 DEGS1O15121 323 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 IFNA2P01563 188 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 RPA2P15927 270 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 KITLGP21583 273 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 GLP1RP43220 463 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 NAAAQ02083 359 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 C11orf87Q6NUJ2 197 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 NRIP2Q9BQI9 281 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ARL6Q9H0F7 186 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 IFT22Q9H7X7 185 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM210A6NLX4 147 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SCTP09683 121 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PGA5P0DJD9 388 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 AADACP22760 399 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM65Q6PI78 240 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 Q6ZR03 302 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 Q8IYB0 196 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 MOB3AQ96BX8 217 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC25A4P12235 298 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF44P15621 663 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 GCH1P30793 250 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PIGPP57054 158 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ACACAQ13085 2346 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 MPTX1A8MV57 137 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 IFNA7P01567 189 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 GLAP06280 429 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 M0R1B8 84 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PRRG2O14669 202 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC34A2O95436 690 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 BMP5P22003 454 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 S100A1P23297 94 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 OR8H3Q8N146 312 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 NMES1Q9C002 83 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 MSL2Q9HCI7 577 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TRDCB7Z8K6 153 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 NXPH2O95156 264 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 UCP3P55916 312 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ABCA11PQ4W5N1 156 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 CXXC4Q9H2H0 198 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ATMQ13315 3056 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 A8MXE2 369 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PPYP01298 95 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 HERV-K104P61576 105 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM27E3Q08E93 113 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 HERPUD1Q15011 391 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 OR10C1Q96KK4 312 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 TNFSF18Q9UNG2 199 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 SIRPB1O00241 398 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 BET1O15155 118 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 OR2H2O95918 312 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 HOXB5P09067 269 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMB6P28072 239 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms