RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.76□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 U3KQV3 271 aa6.76□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PPI3 338 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 LY6LH3BQJ8 138 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TNFRSF11BO00300 401 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 PSPNO60542 156 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF254O75437 659 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IGKV1D-33P01593 117 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IGKV1-33P01594 117 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IGHG4P01861 327 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IFNA6P05013 189 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 COX4I1P13073 169 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 GPR12P47775 334 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 OR3A1P47881 315 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 LYPD6Q86Y78 171 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 DDB2Q92466 427 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SLAMF9Q96A28 289 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 EME1Q96AY2 570 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 GHITMQ9H3K2 345 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 V9GYS6 101 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.75□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 H3BN98 237 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TTRP02766 147 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SPNP16150 400 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ALOX5APP20292 161 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 MYF6P23409 242 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 PSME3P61289 254 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ISL1P61371 349 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 BNIP1Q12981 228 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF146Q15072 292 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 CORO2AQ92828 525 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 BORCS8Q96FH0 119 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ABCG5Q9H222 651 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF580Q9UK33 172 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.74□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ODAMA1E959 279 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 F8VVB4 439 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 F8VWA3 439 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 SIRPB1O00241 398 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 OVOL1O14753 267 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 MPZL2O60487 215 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 GASTP01350 101 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 CSN2P05814 226 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 OR8U9P0C7N5 309 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 PRKACAP17612 351 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 NFYBP25208 207 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 PSMB8P28062 276 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 HMGA2P52926 109 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ACTR3P61158 418 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 RUNX1Q01196 453 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 ROM1Q03395 351 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 HNF4GQ14541 408 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM65Q6PI78 240 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.73□□□□□ -1.33
HLA-B-257ENST00000640094 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms