RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A1P30531 599 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM58AQ8N1B3 248 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RX4Q99571 388 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00527Q9UJ94 153 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL3P20749 454 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKACGP22612 351 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GDNFP39905 211 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NPBWR2P48146 333 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRX1P54821 245 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35B1P78383 322 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ING3Q9NXR8 418 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RYR2Q92736 4967 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FUOMA2VDF0 154 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD6O75354 484 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA3P01011 423 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL1P22362 96 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LUMP51884 338 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A2Q01362 244 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 HES1Q14469 280 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZSR3 168 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF695Q8IW36 515 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 YIPF7Q8N8F6 280 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D6Q8NGJ1 314 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RPEQ96AT9 228 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADI1Q9BV57 179 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R3Q9NYW6 316 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OOSP1A8MZH6 123 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFPL1O95159 310 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGFRP43088 359 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GP2P55259 537 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NKAPLQ5M9Q1 402 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TOMM40LQ969M1 308 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MNTQ99583 582 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST5Q9GZS9 411 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 B2RBV5 119 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA8P13928 327 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NFYBP25208 207 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CD34P28906 385 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GLIPR1P48060 266 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1B3P54709 279 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 AESQ08117 197 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF146Q15072 292 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIN3Q5JUX0 258 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OR56B4Q8NH76 319 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D1BO14796 132 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT8P05787 483 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM11P17152 192 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ECI1P42126 302 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RBP2P50120 134 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42P60953 191 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX5Q99593 518 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MED4Q9NPJ6 270 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DSCAML1Q8TD84 2053 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL24O00175 119 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKYO43930 277 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2H2O95918 312 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 HNF4GQ14541 408 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35E3Q7Z769 313 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRG5Q8IZF4 528 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD1Q8N668 190 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf56Q8N8D9 126 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CORO2AQ92828 525 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RAX2Q96IS3 184 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRL4Q9HBW9 690 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CLN6Q9NWW5 311 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6LH3BQJ8 138 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R129 80 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTN3O75935 186 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF44P15621 663 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CRISP1P54107 249 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN1BQ07699 218 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf66Q5T8R8 295 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXRED2Q8IWF2 684 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5M8Q8NGP6 311 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ODAMA1E959 279 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MTCP1P56278 107 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 KRBOX4Q5JUW0 171 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPERDQ86XM0 798 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 THNSL2Q86YJ6 484 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC7Q8TAX7 377 aa21.58■■□□□ 1.05
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