RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 AQP3Q92482 292 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A28Q96A46 364 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RAB3CQ96E17 227 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MED30Q96HR3 178 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR2V2Q96R30 315 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CHST6Q9GZX3 395 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 POFUT1Q9H488 388 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MSL2Q9HCI7 577 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TREM2Q9NZC2 230 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SPG11Q96JI7 2443 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CENPEQ02224 2701 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 C5orf63A6NC05 138 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 F5H5P2 479 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GABARAPH6UMI1 98 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LDLRAD4O15165 306 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TXNL1O43396 289 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HPGDSO60760 199 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MPIG6BO95866 241 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1-46P01743 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TBPP20226 339 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINA2P20848 420 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GLRA1P23415 457 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS3P35030 304 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR3A4PP47883 348 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00310P59036 64 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ERVS71-1P61550 626 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 QRFPP83859 136 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF154Q13106 437 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 IL18Q14116 193 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF146Q15072 292 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ACTBL2Q562R1 376 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PYDC2Q56P42 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TRIQKQ629K1 86 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CNIH2Q6PI25 160 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZTK2 550 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC190Q86UF4 302 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.19□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 RAB1CQ92928 201 aa6.19□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FZR1Q9UM11 496 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DSCAMO60469 2012 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 COL12A1Q99715 3063 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087X0M5 115 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GX30 115 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SRRM5B3KS81 715 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CTDSP2O14595 271 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CDIPTO14735 213 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DEGS1O15121 323 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MLNRO43193 412 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PDCD6O75340 191 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RBBP9O75884 186 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PAHP00439 452 aa6.18□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 LPLP06858 475 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HEXAP06865 529 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MELTFP08582 738 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ELK1P19419 428 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RCVRNP35243 200 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TGFBR1P36897 503 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 EFNA4P52798 201 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CAV3P56539 151 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GNG2P59768 71 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ERVK11-1P61568 191 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CDSNQ15517 529 aa6.18□□□□□ -1.42
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