RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

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Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 Q9N2J8 555 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PLSCR3Q9NRY6 295 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 AHSPQ9NZD4 102 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 MTCH1Q9NZJ7 389 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 FZR1Q9UM11 496 aa2.01□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.01□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 OARD1Q9Y530 152 aa2.01□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 GXYLT2A0PJZ3 443 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SLC22A23A1A5C7 686 aa2□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa2□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 TMEM233B4DJY2 109 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF587BE7ETH6 402 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 F6UZH7 168 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 F8WDY8 70 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 H3BN98 237 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SMLR1H3BR10 107 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 FXYD1O00168 92 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PPP6CO00743 305 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 AIREO43918 545 aa2□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 LHBP01229 141 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 IGKV1D-16P01601 117 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 NGFRP08138 427 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 CHRM2P08172 466 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 HTR1AP08908 422 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 WNT2P09544 360 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 UCHL1P09936 223 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 NBEAP1P0C6P0 100 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 RD3LP0DJH9 198 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 OR12D1P0DN82 309 aa2□□□□□ -2.09
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SNORD53-201ENST00000579969 TFPIP10646 304 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 CD28P10747 220 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 G6PDP11413 515 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 ANXA3P12429 323 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF35P13682 527 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 TSPAN8P19075 237 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 GSTM3P21266 225 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 TUBG1P23258 451 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PSMB9P28065 219 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 HTR2AP28223 471 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PSMB10P40306 273 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 AKR1C3P42330 323 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 RBM34P42696 430 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 MAP2K4P45985 399 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 GPR12P47775 334 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 OR3A1P47881 315 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 HTR5AP47898 357 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 KCNJ3P48549 501 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 MMP15P51511 669 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 EFNB2P52799 333 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SLC35A2P78381 396 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PAX2Q02962 417 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 CD47Q08722 323 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 GPR50Q13585 617 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 GTF2H2Q13888 395 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 LAPTM4AQ15012 233 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 POU2AF1Q16633 256 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 DPY19L1Q2PZI1 675 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 UNC50Q53HI1 259 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PAGE3Q5JUK9 113 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 OR2G6Q5TZ20 316 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 SAMD13Q5VXD3 122 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2□□□□□ -2.09
SNORD53-201ENST00000579969 NCR3LG1Q68D85 454 aa2□□□□□ -2.09
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