RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF714	Q96N38	554 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	hADV38S2	A0JD32	116 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MGST3	O14880	152 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRR1	P24046	479 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO1	P25800	156 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DCK	P27707	260 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ETV1	P50549	477 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KISS1	Q15726	138 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF626	Q68DY1	528 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DHDH	Q9UQ10	334 aa		17.64	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	VGLL3	A8MV65	326 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2H2	O95918	312 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS4	P56470	323 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC58	Q4VC31	144 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	BRICD5	Q6PL45	260 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TREML4	Q6UXN2	200 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PPA2	Q9H2U2	334 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf4	Q9NR00	106 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GLS2	Q9UI32	602 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		17.64	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D1B	O14796	132 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RX3	P56373	397 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	IL18R1	Q13478	541 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK5R1	Q15078	307 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6P435	159 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NEK6	Q9HC98	313 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	17.63	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRPB1	O00241	398 aa		17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ARG1	P05089	322 aa		17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6E	Q16553	131 aa		17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC23	Q5W5X9	447 aa		17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MALSU1	Q96EH3	234 aa		17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	17.62	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JK05	382 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HCK	P08631	526 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RCN1	Q15293	331 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CYGB	Q8WWM9	190 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		17.61	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	IRGM	A1A4Y4	181 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST1	O43916	411 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM225B	P0DP42	221 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ELP2	Q6IA86	826 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR148	Q8TDV2	347 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CORO2A	Q92828	525 aa		17.6	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OGG1	O15527	345 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP23A	O75900	390 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LALBA	P00709	142 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CSN2	P05814	226 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB3A	P20336	220 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DS4	P43632	304 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX2	P48431	317 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST4	Q8NCG5	386 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD9	Q8NE22	299 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PXT1	Q8NFP0	134 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		17.59	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRP	O00591	440 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRA5	P31644	462 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GLIPR1	P48060	266 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MTNR1B	P49286	362 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	AES	Q08117	197 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX2	Q16385	188 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCL4	Q6XD76	172 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8NFD4	153 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM106A	Q96A25	262 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM19	Q96E16	107 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ2	Q96H96	371 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB18	Q9NP72	206 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		17.58	■□□□□ 0.41

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