RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MDFICQ9P1T7 246 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM120BA0PK00 339 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 VGLL3A8MV65 326 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 C3orf84H3BNL1 204 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 FXYD1O00168 92 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC22A2O15244 555 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPHA2P29317 976 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR1E2P47887 323 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGM4P49221 684 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 BMXP51813 675 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC18A1P54219 525 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF92Q03936 586 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRKCDQ05655 676 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CORO6Q6QEF8 472 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OAFQ86UD1 273 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCL13Q99616 98 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATF6BQ99941 703 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADA2Q9NZK5 511 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 XKRYO14609 159 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 FFAR1O14842 300 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 XRCC3O43542 346 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC16A7O60669 478 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TXNDC12O95881 172 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGT2P36268 569 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR4P46093 362 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSNK2BP67870 215 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ST3GAL3Q11203 375 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DGUOKQ16854 277 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MICBQ29980 383 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAA40Q86UY6 237 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10A6Q8NH74 314 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC29Q8WV35 223 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEH1LQ96EE3 360 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSSK2Q96PF2 358 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAFA1Q96PS6 74 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 AURKCQ9UQB9 309 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NDX4 124 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PQ18 207 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 F5H5K5 113 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R135 149 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSKH1P11801 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAV3P56539 151 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ECH1Q13011 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGKQ53H12 422 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CASC10Q5T4H9 136 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF799Q96GE5 643 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CENPHQ9H3R5 247 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 U3KQK5 164 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE6AA0A183 80 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 BHLHE40O14503 412 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIGLEC5O15389 551 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFB3O43676 98 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANGPTL7O43827 346 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFF1P04155 84 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAM2Q15035 370 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 RFX4Q33E94 735 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF876PQ49A33 203 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBED5Q49AG3 693 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.63□□□□□ -1.35
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