RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556838.5

RBM23-223, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-223	ENST00000556838	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	SLC35A2	P78381	396 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	RSU1	Q15404	277 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	SPHAR	Q15513	63 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	ELP2	Q6IA86	826 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838		Q6YL49	198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	S100A13	Q99584	98 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-223	ENST00000556838	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	GABRP	O00591	440 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	DEGS1	O15121	323 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	NPFF	O15130	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	OR2H2	O95918	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	RBP4	P02753	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	FBP1	P09467	338 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CALCB	P10092	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF44	P15621	663 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CRHBP	P24387	322 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	LMO1	P25800	156 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	TGFBR2	P37173	567 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	GPR50	Q13585	617 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	DOC2B	Q14184	412 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	MED22	Q15528	200 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838		Q9H521	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	SIRPB1	O00241	398 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	PSPN	O60542	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	PAH	P00439	452 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	SCN1B	Q07699	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	KLRD1	Q13241	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	GPR176	Q14439	515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF273	Q14593	569 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	IRF3	Q14653	427 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	MIDN	Q504T8	468 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838		Q8NFD4	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	UFD1	Q92890	307 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838		A0A0G2JK05	382 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838		A0A0U1RQK1	487 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-223	ENST00000556838	CSN2	P05814	226 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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