RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HIST3H3Q16695 136 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MICBQ29980 383 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FAM209BQ5JX69 171 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GPR157Q5UAW9 335 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 RNLSQ5VYX0 342 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 Q8N402 240 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NUP37Q8NFH4 326 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 COA4Q9NYJ1 87 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MPTX1A8MV57 137 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SNAPINO95295 136 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 CRYBA1P05813 215 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 INPP1P49441 399 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PRDX4Q13162 271 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 C10orf128Q5T292 105 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TMEM163Q8TC26 289 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MRI1Q9BV20 369 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GHITMQ9H3K2 345 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 CLN6Q9NWW5 311 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LRRC30A6NM36 301 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TMEM178BH3BS89 294 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SIRPB1O00241 398 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SURF4O15260 269 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SNAPC5O75971 98 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NXPH2O95156 264 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CRISP1P54107 249 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 WDR38Q5JTN6 314 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 WDR86Q86TI4 376 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLAMF9Q96A28 289 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 HAVCR1Q96D42 359 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 RAB39BQ96DA2 213 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZNF222Q9UK12 451 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 A0A0U1RQK1 487 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 PEX14O75381 377 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 IGHV2-5P01817 119 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 GSK3AP49840 483 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 INSL4Q14641 139 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SPHARQ15513 63 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CNIH2Q6PI25 160 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 KLBQ86Z14 1044 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NEK7Q8TDX7 302 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TMEM203Q969S6 136 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FAM46BQ96A09 425 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TENM3Q9P273 2699 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TOX4O94842 621 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FGF2P09038 288 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.27□□□□□ -1.41
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CS-212ENST00000548567 PPOXP50336 477 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CDC42P60953 191 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FAM3AP98173 230 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLC3A1Q07837 685 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 DOC2BQ14184 412 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 EFNB3Q15768 340 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.27□□□□□ -1.41
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