RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TMEM104Q8NE00 496 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TMEM100Q9NV29 134 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A096LPE4 126 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A0A6YYH2 397 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A1W2PPZ6 126 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A6NJ64 397 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 IFNA10P01566 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CD8AP01732 235 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CD74P04233 296 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CSF1P09603 554 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CD80P33681 288 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 GSK3AP49840 483 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PCBD1P61457 104 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TNFRSF9Q07011 255 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 UBE2V2Q15819 145 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ACTBL2Q562R1 376 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 V9GYS6 101 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A0B4J2A0 478 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A1W2PP11 408 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 MPIG6BO95866 241 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CEACAM1P13688 526 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 THBS4P35443 961 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PMELP40967 661 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 GNG10P50151 68 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 MEF2DQ14814 521 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 KISS1Q15726 138 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 RNF141Q8WVD5 230 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 APH1AQ96BI3 265 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 NICN1Q9BSH3 213 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 METTL9Q9H1A3 318 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 BANF2Q9H503 90 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 BCO1Q9HAY6 547 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 COMMD9Q9P000 198 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CACNA1GO43497 2377 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SVILO95425 2214 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 A0A1W2PPE2 198 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TM4SF5O14894 197 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZNHIT1O43257 154 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 FAM157CP0CG43 387 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 AKAIN1P0CW23 69 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SLC25A4P12235 298 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 NBL1P41271 181 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CAV2P51636 162 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ACTBP60709 375 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ACTG1P63261 375 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 LIN54Q6MZP7 749 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 DTD1Q8TEA8 209 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PP6455Q8WZ26 134 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PIGTQ969N2 578 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 REEP6Q96HR9 211 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 UPB1Q9UBR1 384 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 AKAP13Q12802 2813 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ZNF724A8MTY0 619 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 NUDT19A8MXV4 375 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 M0R036 132 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 WISP2O76076 250 aa7.13□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 HLA-HP01893 362 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms