RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 GNB4Q9HAV0 340 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 KIAA1456Q9P272 454 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.68□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 A0A1B0GTI1 187 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 A0A1W2PPI3 338 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 PRR32B1ATL7 298 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 DLGAP1O14490 977 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 MGST3O14880 152 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 HAND1O96004 215 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV1D-33P01593 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV1-33P01594 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CGB3P0DN86 165 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CGB7P0DN87 165 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CALCBP10092 127 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ALOX5APP20292 161 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 GABRR1P24046 479 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR3A1P47881 315 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 GLIPR1P48060 266 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 NPBWR2P48146 333 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 NUDT2P50583 147 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 P2RX3P56373 397 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 GNB1P62873 340 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CBX1P83916 185 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RUNX1Q01196 453 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 HES1Q14469 280 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 Q8N9W7 124 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 PYURFQ96I23 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 NABP2Q9BQ15 211 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SPATA25Q9BR10 227 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ABCG5Q9H222 651 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 U3KQV3 271 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 J3QR06 171 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OVOL1O14753 267 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SAP30O75446 220 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 DHRS3O75911 302 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 LY6G6CO95867 125 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IGHV3-7P01780 117 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR8U8P0C7N1 319 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RRM2P31350 389 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 POU3F4P49335 361 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF91Q05481 1191 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 AESQ08117 197 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF616Q08AN1 781 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 UBE2V2Q15819 145 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ACSM6Q6P461 480 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 Q6ZSR3 168 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 Q8N6K4 173 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 IL17DQ8TAD2 202 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 DDB2Q92466 427 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SLAMF9Q96A28 289 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 RPEQ96AT9 228 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CEP19Q96LK0 163 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 OR5B12Q96R08 314 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 MNTQ99583 582 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 GON7Q9BXV9 100 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 CMC2Q9NRP2 79 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 V9GYQ6 96 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 V9GYS6 101 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 SORL1Q92673 2214 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-211ENST00000524095 DNAH2Q9P225 4427 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms