RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 NAGKQ9UJ70 344 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP54Q96N23 3096 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A6NLC8 198 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZIC3O60481 467 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PGA4P0DJD7 388 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PGA3P0DJD8 388 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CPN1P15169 458 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MGMTP16455 207 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINA2P20848 420 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA5P43359 124 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM33P57088 247 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PMPCAQ10713 525 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GUK1Q16774 197 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRG7Q96K78 797 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NELFAQ9H3P2 528 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NOX3Q9HBY0 568 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MSL2Q9HCI7 577 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DOK5Q9P104 306 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GGT3PA6NGU5 568 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DVL1O14640 695 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IFNA21P01568 189 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DBHP09172 617 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH3B1P43353 468 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR3A2P47893 321 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 EFNB2P52799 333 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ROM1Q03395 351 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT16Q8N428 558 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ARL11Q969Q4 196 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR10A2Q9H208 303 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 C21orf140B9A014 251 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 M0QYG6 137 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2A4O95047 310 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PMS2P2O95744 297 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IRF2P14316 349 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FAHP16930 419 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MMP16P51512 607 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 F2RL1P55085 397 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PLP2Q04941 152 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 KHDC3LQ587J8 217 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZTK2 550 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM8Q96KF7 97 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2A7Q96R45 310 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TTRP02766 147 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FCGR2AP12318 317 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RRADP55042 308 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HAS2Q92819 552 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CMBLQ96DG6 245 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PR64 198 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PRV1 198 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CYB5BO43169 146 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms