RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148		F8VVB4	439 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148		F8VWA3	439 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GPR137B	O60478	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	KDM4B	O94953	1096 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	INMT	O95050	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ALDOB	P05062	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	NPBWR2	P48146	333 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DLX1	P56177	255 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ZP1	P60852	638 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ARF6	P62330	175 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	UFD1	Q92890	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GABRP	O00591	440 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CRYBA1	P05813	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CHRM2	P08172	466 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PRKACA	P17612	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BDKRB2	P30411	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IER3	P46695	156 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GPR50	Q13585	617 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PQ09	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	GPX5	O75715	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	HAND1	O96004	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	BMX	P51813	675 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PROK1	P58294	105 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	COL10A1	Q03692	680 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	PDCD1	Q15116	288 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	DYRK2	Q92630	601 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CLPX	O76031	633 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TK1	P04183	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MTNR1B	P49286	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF146	Q15072	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TAF9	Q16594	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZSV7	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ORAI1	Q96D31	301 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPH5	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		K7N7A8	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF737	O75373	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TSPAN15	O95858	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TGFBR2	P37173	567 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TPBG	Q13641	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms