RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 E7EQL1 145 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 H3BSA7 217 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 H3BTX0 84 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 H7C1C5 153 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DCTN6O00399 190 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SH2D1BO14796 132 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SURF4O15260 269 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SOX14O95416 240 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ALPLP05186 524 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF32P17041 273 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PCMT1P22061 227 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CA6P23280 308 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IGFBP5P24593 272 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 STOMP27105 288 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FMO3P31513 532 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 APLNRP35414 380 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GLRXP35754 106 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CAPGP40121 348 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ERFP50548 548 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 LCN6P62502 163 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HIST1H3AP68431 136 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PSG4Q00888 419 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ECH1Q13011 328 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GINS1Q14691 196 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ETFDHQ16134 617 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 MOGQ16653 247 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PCK2Q16822 640 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ARL9Q6T311 187 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF584Q8IVC4 421 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 MUC15Q8N387 334 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FBXO17Q96EF6 278 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RDH12Q96NR8 316 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SH3GL3Q99963 347 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF747Q9BV97 191 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 NOX3Q9HBY0 568 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CA10Q9NS85 328 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.63□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.671e-6■■■□□ 14.9
NHLRC3-205ENST00000485407 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR6C6A6NF89 314 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 H0YL77 283 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 WRBO00258 174 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CCSO14618 274 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SGCEO43556 437 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SAP30O75446 220 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRSS2P07478 247 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 STAG3L3P0CL85 134 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF823P16415 610 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SPI1P17947 270 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CALCRP30988 508 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GGT2P36268 569 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HTR5AP47898 357 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RGS6P49758 472 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FABP6P51161 128 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FUT6P51993 359 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CDC42P60953 191 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 BTG1P62324 171 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 TUBA1BP68363 451 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CRMP1Q14194 572 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RAB35Q15286 201 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.62□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms