RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 TRAM1Q15629 374 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SPIN3Q5JUX0 258 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM91Q6ZNR0 172 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf107Q6ZR85 190 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 KIR3DL3Q8N743 410 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 LHX4Q969G2 390 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CHST6Q9GZX3 395 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SIRT7Q9NRC8 400 aa21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SIRPB1O00241 398 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PSPNO60542 156 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CDRT1O95170 752 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MAS1P04201 325 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 FPR2P25090 351 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 RPL31P62899 125 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 FABP5Q01469 135 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX22Q96L94 193 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 DMRTB1Q96MA1 342 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MDFIQ99750 246 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXJ3Q9UPW0 622 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 VENTXO95231 258 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 GABRR1P24046 479 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PTGFRP43088 359 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 TUSC1Q2TAM9 212 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR157Q5UAW9 335 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CEACAM19Q7Z692 300 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PDZD9Q8IXQ8 264 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CMTM4Q8IZR5 234 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 OR8H2Q8N162 312 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 RHOFQ9HBH0 211 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2H2O95918 312 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 MTNR1BP49286 362 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PDCD1Q15116 288 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ASCL4Q6XD76 172 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 OR4S1Q8NGB4 309 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 THRSPQ92748 146 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 GLS2Q9UI32 602 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SH2D1BO14796 132 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 EDDM3BP56851 147 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 KLRD1Q13241 179 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 EDDM3AQ14507 147 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF273Q14593 569 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 RSU1Q15404 277 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM200BQ69YZ2 307 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ELP2Q6IA86 826 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 Q6P435 159 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SUCNR1Q9BXA5 334 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ING4Q9UNL4 249 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 M0R1W7 72 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 HTR3BO95264 441 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 CCL3L1P16619 93 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 OR3A1P47881 315 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SCN1BQ07699 218 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 GRK1Q15835 563 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 C9orf139Q6ZV77 190 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 GDPD3Q7L5L3 318 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 JAGN1Q8N5M9 183 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TPRX1Q8N7U7 411 aa21.74■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TFAP2AP05549 437 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 UCHL1P09936 223 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF44P15621 663 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 CD36P16671 472 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 HILS1P60008 231 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PIGYQ3MUY2 71 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 USP43Q70EL4 1123 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 Q8NFD4 153 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ESM1Q9NQ30 184 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV1-69P01742 117 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 LYPD6Q86Y78 171 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5D13Q8NGL4 314 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TNFRSF14Q92956 283 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 YIPF6Q96EC8 236 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 METTL9Q9H1A3 318 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 OR51E2Q9H255 320 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PPA2Q9H2U2 334 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 COL6A5A8TX70 2615 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0A6YYJ9 748 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PP11 408 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF212BA8MTL3 300 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SERPINA2P20848 420 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4-202ENST00000483873 LMO1P25800 156 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms