RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB3CQ96E17 227 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SDSLQ96GA7 329 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 WDFY2Q96P53 400 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NICN1Q9BSH3 213 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MIOXQ9UGB7 285 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF222Q9UK12 451 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LRBAP50851 2863 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0A6YYD4 124 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB27BO00194 218 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGLEC5O15389 551 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SOCS1O15524 211 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC3O43542 346 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TPPPO94811 219 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A16P16260 332 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ELK1P19419 428 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK2P24941 298 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNJ3P48549 501 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IL13RA1P78552 427 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 COL10A1Q03692 680 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 AVPI1Q5T686 147 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZTK2 550 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LAX1Q8IWV1 398 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CD177Q8N6Q3 437 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX22Q96L94 193 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL13Q99616 98 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXC2Q99958 501 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HSF4Q9ULV5 492 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 POLQO75417 2590 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINE3A8MV23 424 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 VWC2LB2RUY7 222 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRPB1O00241 398 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPRSS2O15393 492 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM20O43506 726 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFB3O43676 98 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HEXAP06865 529 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CHATP28329 748 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFSF8P32971 234 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MNDAP41218 407 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NR4A2P43354 598 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM50BP56557 158 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PDCD1Q15116 288 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CNIH2Q6PI25 160 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NEK7Q8TDX7 302 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GAFA1Q96PS6 74 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8B2Q96RD0 313 aa7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms