RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PRV1 198 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf98A8MV24 154 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ALX3O95076 343 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 GABARAPO95166 117 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 DLX6P56179 175 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MTCP1P56278 107 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 RAB40BQ12829 278 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 Q8IYB0 196 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR5R1Q8NH85 324 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01006Q8NI28 216 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SGCDQ92629 289 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SLAMF9Q96A28 289 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SPSB1Q96BD6 273 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 YIPF6Q96EC8 236 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SNX22Q96L94 193 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ALG8Q9BVK2 526 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 AMBNQ9NP70 447 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM82A0PJX8 343 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 INMTO95050 263 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 PAHP00439 452 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CCL3L1P16619 93 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 NPBWR2P48146 333 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ERVFRD-1P60508 538 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 PDZK1IP1Q13113 114 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF273Q14593 569 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF146Q15072 292 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 AANATQ16613 207 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR8H2Q8N162 312 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OPALINQ96PE5 141 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MND1Q9BWT6 205 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 JAM3Q9BX67 310 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 C16orf95Q9H693 158 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 BTBD17A6NE02 478 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 E9PI62 339 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MYL12BO14950 172 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 KCNAB3O43448 404 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ANGPTL7O43827 346 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TSPAN9O75954 239 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CLPXO76031 633 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZFPL1O95159 310 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CYB5AP00167 134 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 RBP4P02753 201 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF20P17024 532 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MYL12AP19105 171 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TGFBR2P37173 567 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MAP2K4P45985 399 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZSV7 163 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF676Q8N7Q3 588 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf50Q8WW18 174 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CITED1Q99966 193 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 RHOFQ9HBH0 211 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM212A6NML5 194 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 HAND1O96004 215 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1D-12P01611 117 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LIMS3P0CW19 117 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LIMS4P0CW20 117 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF728P0DKX0 622 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 CD36P16671 472 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 BCL3P20749 454 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 LMO1P25800 156 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SERPINB10P48595 397 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 PROK1P58294 105 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf3-210ENST00000462125 RNF144BQ7Z419 303 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms