RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PKIBQ9C010 78 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DECR2Q9NUI1 292 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 STARD10Q9Y365 291 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 U3KQ87 197 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 L7N2F9 121 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ANGPTL7O43827 346 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1D-12P01611 117 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A4P12235 298 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF35P13682 527 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CBR1P16152 277 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PPP3CBP16298 524 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF81P51508 661 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ARPC4P59998 168 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP10-9P60411 292 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GNG3P63215 75 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PMP22Q01453 160 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R1AQ13522 171 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TAF9Q16594 264 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MPV17LQ2QL34 196 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZS49 121 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MDP1Q86V88 176 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF611Q8N823 705 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 COQ8AQ8NI60 647 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 EHFQ9NZC4 300 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 COMMD9Q9P000 198 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DNHD1Q96M86 4753 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DBX1A6NMT0 343 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C19orf84I3L1E1 186 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TOXO94900 526 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SFT2D2O95562 160 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NGFP01138 241 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RAC2P15153 192 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RPA2P15927 270 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 COX5AP20674 150 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-2P23083 117 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HOXC12P31275 282 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FGF12P61328 243 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IL24Q13007 206 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OPCMLQ14982 345 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 P2RY6Q15077 328 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GABRA6Q16445 453 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CDH20Q9HBT6 801 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RAB18Q9NP72 206 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 AK3Q9UIJ7 227 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GPR160Q9UJ42 338 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TINAGQ9UJW2 476 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MED12Q93074 2177 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0D9SG52 128 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR5H14A6NHG9 310 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF732B4DXR9 585 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TSC22D2O75157 780 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms