RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 VAMP8Q9BV40 100 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ASB6Q9NWX5 421 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 VDAC3Q9Y277 283 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0J9YY10 115 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GX78 115 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PR77 199 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MEGF11A6BM72 1044 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HIDE1A8MVS5 230 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 XRCC3O43542 346 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP4BP51164 291 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT6P51993 359 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP1B3P54709 279 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CTBP1Q13363 440 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0040Q15053 153 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NIPAL3Q6P499 406 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4X1Q8NH49 305 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM18Q96B42 140 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RDH14Q9HBH5 336 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 F2RL2O00254 374 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRPO00591 440 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 GRAP2O75791 330 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NRASP01111 189 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R31P59538 309 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 C3AR1Q16581 482 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA25Q9BR10 227 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ANK1P16157 1881 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MCM3APO60318 1980 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 GGT3PA6NGU5 568 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL10P02778 98 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT1P04628 370 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLURP2P0DP57 97 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS12P56730 875 aa5.91□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MRAPQ8TCY5 172 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR76Q9H967 626 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NRN1Q9NPD7 142 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL15Q9NXU5 204 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPI3 338 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SH2D1BO14796 132 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NKX2-8O15522 239 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PGCP20142 388 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL2P36404 184 aa5.91□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 LFNGQ8NES3 379 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4L1Q8NH43 312 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF11O14788 317 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L11O43521 198 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN11O75508 207 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 UBL3O95164 117 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TTRP02766 147 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ELK1P19419 428 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NMBRP28336 390 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.91□□□□□ -1.46
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