RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PR64 198 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRV1 198 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FUOMA2VDF0 154 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 DEGS1O15121 323 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF737O75373 536 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SC5DO75845 299 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR3BO95264 441 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 UCHL1P09936 223 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CALCBP10092 127 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF44P15621 663 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHA1P21709 976 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 BPIFB3P59826 476 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 INSL4Q14641 139 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR157Q5UAW9 335 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFRL1Q8N441 504 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8NFD4 153 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OCEL1Q9H607 264 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GHRLQ9UBU3 117 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R1W7 72 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CCRL2O00421 344 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MGST3O14880 152 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CDRT1O95170 752 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFAIP8O95379 198 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2H2O95918 312 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FSHBP01225 129 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2F2P13984 249 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GALP22466 123 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LMO1P25800 156 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMB9P28065 219 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SCN1BQ07699 218 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 IL13RA2Q14627 380 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GRK1Q15835 563 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OSR2Q8N2R0 312 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 BPIFB2Q8N4F0 458 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51T1Q8NGJ9 327 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MUL1Q969V5 352 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SIRPDQ9H106 197 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 IL36RNQ9UBH0 155 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0A6YYJ9 748 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM82A0PJX8 343 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BUI4 141 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SIRPB1O00241 398 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 UBBP0CG47 229 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD7P51665 324 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 EDDM3BP56851 147 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FABP5Q01469 135 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A6Q4U2R8 563 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NHLRC3Q5JS37 347 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 AWAT2Q6E213 333 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00596Q86U02 117 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SUCNR1Q9BXA5 334 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WXM4 84 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JK05 382 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 hADV38S2A0JD32 116 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP9P14780 707 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINA2P20848 420 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SSX1Q16384 188 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6P435 159 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRTM1Q86UE6 522 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10K1Q8NGX5 313 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 JMJD8Q96S16 334 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX15Q96SF7 602 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ST3GAL6Q9Y274 331 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD5O14737 125 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TCF21O43680 179 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PSPNO60542 156 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CSN2P05814 226 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PRTN3P24158 256 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 OR3A1P47881 315 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNJ3P48549 501 aa12.66□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms