RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373920.6

PSMD5-204, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 5, human

TSL 5

Gene PSMD5, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD5-204	ENST00000373920	MPZL2	O60487	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CLIC3	O95833	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	KNG1	P01042	644 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TK1	P04183	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CHRM2	P08172	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	FBP1	P09467	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CCL3L1	P16619	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PRKACA	P17612	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GABRB1	P18505	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ATF1	P18846	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	BCL3	P20749	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PRKACB	P22694	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GABRR1	P24046	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	MPZ	P25189	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SAA4	P35542	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	IER3	P46695	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	NPBWR2	P48146	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RBP2	P50120	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	UBE2E1	P51965	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RAG2	P55895	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	LGALS4	P56470	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ISL1	P61371	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ACTA2	P62736	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ACTG2	P63267	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SCN1B	Q07699	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	IL24	Q13007	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GALE	Q14376	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	LY6E	Q16553	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PKIB	Q9C010	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920		E9PQ18	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920		K7N7A8	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SIRPB1	O00241	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ZFPL1	O95159	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	HAND1	O96004	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ISG15	P05161	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	HCK	P08631	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	SOX2	P48431	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	CCR9	P51686	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	BMX	P51813	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RAB40B	Q12829	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF273	Q14593	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD5-204	ENST00000373920	RCN1	Q15293	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms