RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366977.7

NSL1-202, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSL1, Length 2,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-202ENST00000366977 SLAMF9Q96A28 289 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ZNF488Q96MN9 340 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NGFP01138 241 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 OR8U9P0C7N5 309 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 BCL3P20749 454 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 AADACP22760 399 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 GFRA1P56159 465 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TMEM42Q69YG0 159 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 OSR2Q8N2R0 312 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 OR8U1Q8NH10 309 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TP53RKQ96S44 253 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CALHM2Q9HA72 323 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 RHOFQ9HBH0 211 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.5□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DEDDO75618 318 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ZNF728P0DKX0 622 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ZFP82Q8N141 532 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ZNF611Q8N823 705 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ARL11Q969Q4 196 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TINAGQ9UJW2 476 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 C9orf172C9J069 976 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 K7EPK0 472 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CER1O95813 267 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NR2C1P13056 603 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NAAAQ02083 359 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NHLH2Q02577 135 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SPSB1Q96BD6 273 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PRRX2Q99811 253 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NAA60Q9H7X0 242 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 LRFN1Q9P244 771 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.49□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NME2P1O60361 137 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NEURL1O76050 574 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ASCL4Q6XD76 172 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 Q6ZRG5 221 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SEC11CQ9BY50 192 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 MMP26Q9NRE1 261 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 KNTC1P50748 2209 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SCTP09683 121 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 FOLR2P14207 255 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CD80P33681 288 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PLA2G5P39877 138 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 MAGEA5P43359 124 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CYB561P49447 251 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 GPM6AP51674 278 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TGIF1Q15583 401 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SMIM8Q96KF7 97 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 SGCZQ96LD1 299 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 DECR2Q9NUI1 292 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.48□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 LAMA5O15230 3695 aa9.47□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.47□□□□□ -0.89
NSL1-202ENST00000366977 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms