RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 WNT3P56703 355 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 SNURFLB1AK76 121 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
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