RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 GABRR1P24046 479 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 CDAP32320 146 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 BLKP51451 505 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 FOXF1Q12946 379 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 MYBPHQ13203 477 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 OR8B8Q15620 311 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NSDHLQ15738 373 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 SLC35G3Q8N808 338 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 SPSB1Q96BD6 273 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PGAM5Q96HS1 289 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 VDAC3Q9Y277 283 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NCOR1O75376 2440 aa9.79□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 B4DGG1 531 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 EFNA2O43921 213 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 IGHV4-34P06331 123 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 GZMBP10144 247 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 CD200P41217 278 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 MTCP1P56278 107 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 TFF2Q03403 129 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 OR8G1Q15617 311 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 EXT1Q16394 746 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 RELTQ969Z4 430 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 IER2Q9BTL4 223 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 METTL9Q9H1A3 318 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PRO1933Q9H354 126 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GWJ7 208 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 C5orf63A6NC05 138 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 METTL12A8MUP2 240 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 FAHP16930 419 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 MSX1P28360 303 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 HOXA6P31267 233 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 CCR5P51681 352 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 RRADP55042 308 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 TAS2R30P59541 319 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 HIST1H3AP68431 136 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 C1orf61Q13536 156 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PARM1Q6UWI2 310 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.78□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 SEC16AO15027 2179 aa9.77□□□□□ -0.84
GINS3-202ENST00000328514 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MPPED1O15442 326 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 GCGP01275 180 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 QDPRP09417 244 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NR2C1P13056 603 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 MYOGP15173 224 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 PNLIPP16233 465 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 RNF4P78317 190 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ID3Q02535 119 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 PMS2P11Q13670 270 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 HNF4GQ14541 408 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 GJC3Q8NFK1 279 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 POM121Q96HA1 1249 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TMEM68Q96MH6 324 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 OXGR1Q96P68 337 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 TP53RKQ96S44 253 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS3-202ENST00000328514 P2RX4Q99571 388 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms