RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ARPC4P59998 168 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PSG7Q13046 419 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR2F1Q13607 317 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 P2RY6Q15077 328 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TSC22D1Q15714 1073 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KCTD9Q7L273 389 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF546Q86UE3 836 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 GAPTQ8N292 157 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 LRTM2Q8N967 370 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 POC1AQ8NBT0 407 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MOB3AQ96BX8 217 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TMEM165Q9HC07 324 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 WASF3Q9UPY6 502 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.64□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 A0A1W2PR80 420 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MPTX1A8MV57 137 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 J3QT63 122 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TUSC2O75896 110 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PSMB6P28072 239 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ERVS71-1P61550 626 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 NAXEQ8NCW5 288 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 COQ8AQ8NI60 647 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR10C1Q96KK4 312 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ARL6Q9H0F7 186 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CDH20Q9HBT6 801 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MED9Q9NWA0 146 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.63□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 LRP5LA4QPB2 252 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KLK10O43240 276 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ADAP1O75689 374 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 RHBDL1O75783 438 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FCGR2CP31995 323 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 IGFBP7Q16270 282 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ESCO2Q56NI9 601 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SHEQ5VZ18 495 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SLC22A25Q6T423 547 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SLC51BQ86UW2 128 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MARVELD3Q96A59 401 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 C2orf50Q96LR7 162 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PRR13Q9NZ81 148 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KIF25Q9UIL4 384 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 WDR1O75083 606 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 IFNA2P01563 188 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KITLGP21583 273 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TIMP3P35625 211 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 MPV17P39210 176 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TMEM187Q14656 261 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 HERPUD1Q15011 391 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 PCSK4Q6UW60 755 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 OR8H3Q8N146 312 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 BATF2Q8N1L9 274 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 ZNF488Q96MN9 340 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 HES4Q9HCC6 221 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 RDH8Q9NYR8 311 aa9.62□□□□□ -0.87
PGA3-201ENST00000325558 TREM2Q9NZC2 230 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms