RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 C20orf24Q9BUV8 137 aa21.86■■□□□ 1.09
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HOXB3-201ENST00000311626 E5RGE8 158 aa21.85■■□□□ 1.09
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF175Q9Y473 711 aa21.82■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 OR51B6Q9H340 312 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 TSC22D1Q15714 1073 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 COLCA2A8K830 154 aa21.79■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 ST8SIA3O43173 380 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 CYTIPO60759 359 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 GNRHRP30968 328 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 AVPI1Q5T686 147 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 TUSC5Q8IXB3 177 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 ISOC2Q96AB3 205 aa21.79■■□□□ 1.08
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