RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT2BQ93097 391 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10A2Q9H208 303 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MED29Q9NX70 200 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MSGN1A6NI15 193 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SOCS1O15524 211 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNAB3O43448 404 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAP1O75689 374 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 JTBO76095 146 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBA1P05813 215 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB5BP61020 215 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD55Q3KP44 614 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 HRH4Q9H3N8 390 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO24O75426 580 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM50BP56557 158 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFRP1Q13795 201 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNMB1Q16558 191 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM76BQ5HYJ3 339 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 BTNL8Q6UX41 500 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM104Q8NE00 496 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RXFP4Q8TDU9 374 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-6A6NCS4 301 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS44E7EML9 344 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP5P22003 454 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB32Q13637 225 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 P4HA3Q7Z4N8 544 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KPTNQ9Y664 436 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A27PA6NNH2 459 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINE3A8MV23 424 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHG1P01857 330 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 HCKP08631 526 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR3AP08637 254 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SFTA3P0C7M3 94 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SPP1P10451 314 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF84P51523 738 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF212Q495C1 297 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR10C1Q96KK4 312 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SMCO1Q147U7 214 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 UEVLDQ8IX04 471 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD6BQ8NI32 183 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SFT2D1Q8WV19 159 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MED6O75586 246 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA2P01563 188 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PRF1P14222 555 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 COL8A1P27658 744 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR3A4PP47883 348 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A8P05109 93 aa22.7■■□□□ 1.22
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CAPNS1-201ENST00000246533 RAC3P60763 192 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM3AP98173 230 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ECH1Q13011 328 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD2Q86X83 199 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GPER1Q99527 375 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-201ENST00000246533 COLCA2A8K830 154 aa22.69■■□□□ 1.22
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