RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 VMO1Q7Z5L0 202 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM19Q7Z692 300 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 LRRTM1Q86UE6 522 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CDH26Q8IXH8 852 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR8H2Q8N162 312 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 THRSPQ92748 146 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A7Q99884 636 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 IL36GQ9NZH8 169 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.3■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JK05 382 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SH2D1BO14796 132 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR3A1P47881 315 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 RPL31P62899 125 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 CHST6Q9GZX3 395 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OCEL1Q9H607 264 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ING4Q9UNL4 249 aa18.29■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SIRPB1O00241 398 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 VENTXO95231 258 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 DLX6P56179 175 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 FABP5Q01469 135 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ZNF273Q14593 569 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 BRD3OSQ6XYD6 125 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 TCF23Q7RTU1 214 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 FAM185AQ8N0U4 392 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR4D6Q8NGJ1 314 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 OR5D13Q8NGL4 314 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 MDFIQ99750 246 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ZNF581Q9P0T4 197 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 COL6A5A8TX70 2615 aa18.28■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PP11 408 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ09 198 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 M0R1W7 72 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SRMP19623 302 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 BMXP51813 675 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 ERVFRD-1P60508 538 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 RSU1Q15404 277 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 USP43Q70EL4 1123 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 LHX4Q969G2 390 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 MUL1Q969V5 352 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 METTL9Q9H1A3 318 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 SIRT7Q9NRC8 400 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 GLS2Q9UI32 602 aa18.27■□□□□ 0.52
SYF2-201ENST00000236273 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TCF21O43680 179 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 HTR3BO95264 441 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CCL3L1P16619 93 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GABRR1P24046 479 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 FPR2P25090 351 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SCGB2A2Q13296 93 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TRAM1Q15629 374 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GRK1Q15835 563 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PIGYQ3MUY2 71 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 NHLRC3Q5JS37 347 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 HCP5Q6MZN7 132 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 JAGN1Q8N5M9 183 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TPRX1Q8N7U7 411 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PHYHIPQ92561 330 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GFI1Q99684 422 aa18.26■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TRAV24A0A0B4J272 114 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MEGF11A6BM72 1044 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MGST3O14880 152 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-69P01742 117 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PRTN3P24158 256 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GABRA5P31644 462 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 HILS1P60008 231 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 IL13RA2Q14627 380 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B12Q53GQ0 312 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GPR157Q5UAW9 335 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF773Q6PK81 442 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CMTM4Q8IZR5 234 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SVOPQ8N4V2 548 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TCF7L1Q9HCS4 588 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ESM1Q9NQ30 184 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYJ9 748 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 DEGS1O15121 323 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF44P15621 663 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ERP29P30040 261 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 EDDM3BP56851 147 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 BPIFB3P59826 476 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SCN1BQ07699 218 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 KCTD21Q4G0X4 260 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms