RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 PCED1AQ9H1Q7 454 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 NKX2-6A6NCS4 301 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 H0YL77 283 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 IGKV1D-12P01611 117 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 PATE4P0C8F1 98 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFA6P56556 154 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 GNMTQ14749 295 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF774Q6NX45 483 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 FBXL14Q8N1E6 418 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 LRTM2Q8N967 370 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 FREM2Q5SZK8 3169 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 IGSF23A1L1A6 192 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 H3BQ15 152 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 NXPH3O95157 252 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RAB2AP61019 212 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 MUCL1Q96DR8 90 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PQM1 296 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 LCATP04180 440 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 AADACP22760 399 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 HTR5AP47898 357 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RBP2P50120 134 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RAB1AP62820 205 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 OR2C3Q8N628 320 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RAB39BQ96DA2 213 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 BORCS8Q96FH0 119 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 LIPGQ9Y5X9 500 aa23.42■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RBFOX3A6NFN3 312 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 GDF9O60383 454 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF724A8MTY0 619 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 TNFSF11O14788 317 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 CCL3P10147 92 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 CRYGSP22914 178 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 PYY3Q5JQD4 70 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 OR2B11Q5JQS5 317 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 FAM27BQ5VT28 67 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 SPSB3Q6PJ21 355 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 OR4D5Q8NGN0 318 aa23.41■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 RND3P61587 244 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 CCL7P80098 99 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 LFNGQ8NES3 379 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ANGPTL4Q9BY76 406 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 FRYLO94915 3013 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ZIC3O60481 467 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 CXCL1P09341 107 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 ST3GAL6Q9Y274 331 aa23.4■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.39■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 VAMP5O95183 116 aa23.39■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 NTNG2Q96CW9 530 aa23.39■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 SYT3Q9BQG1 590 aa23.39■■□□□ 1.34
FAM149A-201ENST00000227065 SSSCA1O60232 199 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 RUNX1Q01196 453 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 OSR2Q8N2R0 312 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM217Q8N7C4 229 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC54Q8NEL0 328 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 Q8WTZ3 238 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 A0A0J9YW62 118 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 CST7O76096 145 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 HERV-K104P61576 105 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF674Q2M3X9 581 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 C1QL4Q86Z23 238 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 MOB3AQ96BX8 217 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 DOK5Q9P104 306 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 SYNGR3O43761 229 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 NRASP01111 189 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 HOXA5P20719 270 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 OR14L1PQ8NHC6 308 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF286AQ9HBT8 521 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 A0A087WZY1 265 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 TERTO14746 1132 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2KP61086 200 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 HIKESHIQ53FT3 197 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 SRXN1Q9BYN0 137 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 BCO1Q9HAY6 547 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.38■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 NTF4P34130 210 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 MAS1LP35410 378 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 PCOLCEQ15113 449 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 RAB35Q15286 201 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 PDZD11Q5EBL8 140 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 PROK2Q9HC23 129 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 CRLF2Q9HC73 371 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 DKKL1Q9UK85 242 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 TMED3Q9Y3Q3 217 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 LIFP15018 202 aa23.37■■□□□ 1.33
FAM149A-201ENST00000227065 ERVFRD-1P60508 538 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms