RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Calhm1	D3Z291	348 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stxbp1	O08599	594 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ehf	O70273	300 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01822	137 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Csn2	P10598	231 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fah	P35505	419 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpl12	P35979	165 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ostn	P61364	130 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab3a	P63011	220 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pax8	Q00288	457 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lgals3bp	Q07797	577 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plpp5	Q3UMZ3	260 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem253	Q3UNB8	204 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Myo1g	Q5SUA5	1024 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Orm1	Q60590	207 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr111	Q7TRK1	317 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	B3galnt2	Q8BG28	504 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmsb15l	Q8C0W0	80 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem252	Q8C353	183 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lin52	Q8CD94	116 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aoc1	Q8JZQ5	751 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Amdhd2	Q8JZV7	409 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taf10	Q8K0H5	218 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnfaip8l1	Q8K288	186 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ebf4	Q8K4J2	599 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc29a4	Q8R139	528 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r220	Q8R272	298 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r37	Q8R2E4	302 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cox4i2	Q91W29	172 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dok4	Q99KE3	325 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tada1	Q99LM9	335 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ecrg4	Q99LS0	148 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mpped2	Q9CZJ0	294 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcbd2	Q9CZL5	136 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snrnp48	Q9D361	337 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sohlh2	Q9D489	467 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem30c	Q9D4D7	342 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hpgds	Q9JHF7	199 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc22	Q9JIG7	627 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dolpp1	Q9JMF7	238 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Faim	Q9WUD8	179 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpbg	Q9Z0L0	426 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klk4	Q9Z0M1	255 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex11b	Q9Z210	259 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm17087	V9GXQ2	156 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adgra3	Q7TT36	1310 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cytl1	A1E5L0	139 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm27029	A2A4P4	543 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttll9	A2APC3	461 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1214	A2ATG3	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1188	A2AV10	312 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Samd13	D3YUG0	102 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wisp3	D3Z5L9	354 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smim20	D3Z7Q2	69 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r79	E9Q067	851 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adam3	F8VQ03	822 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21775	J3KMK6	180 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21788	J3QNH3	180 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1425	K7N659	312 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aqp7	O54794	303 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmb9	P28076	219 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mansc4	Q3UU94	337 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21320	Q4FZE8	181 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ei24	Q61070	340 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ces3a	Q63880	571 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prlhr	Q6VMN6	370 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp954	Q7TNU5	416 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tas2r3	Q7TQA7	316 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1137	Q7TR40	310 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1028	Q7TR89	324 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr406	Q7TRX0	323 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Amigo1	Q80ZD8	492 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BHN7	327 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ilvbl	Q8BU33	632 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trub1	Q8C0D0	338 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rps19bp1	Q8C6B9	143 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp27	Q8CEG8	438 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab11fip5	Q8R361	645 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plet1	Q8VEN2	237 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1232	Q8VEX7	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1336	Q8VGH5	314 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Diras1	Q91Z61	198 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Glyr1	Q922P9	546 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rtn4ip1	Q924D0	396 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc25a30	Q9CR58	291 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fopnl	Q9CZS3	174 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pga5	Q9D106	387 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem219	Q9D123	240 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dmac2	Q9D7K5	258 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmg1	Q9JK23	289 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dmrt1	Q9QZ59	374 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccs	Q9WU84	274 aa		3.44	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col1a1	P11087	1453 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv1-75	A0A075B5Y2	117 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	E130218I03Rik	A0A0U1RNU5	63 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mup18	A2BIM8	181 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10320	E9PW43	113 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mfsd4b5	E9PYY6	479 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr913	E9Q716	312 aa		3.43	□□□□□ -1.86
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr726	E9Q8X3	321 aa		3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.7 ms