RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF404Q494X3 552 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 STUMQ69YW2 141 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ELP2Q6IA86 826 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 Q6P435 159 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 OSR2Q8N2R0 312 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CD177Q8N6Q3 437 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RAB1CQ92928 201 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 Q96MF0 132 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CCL13Q99616 98 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 NICN1Q9BSH3 213 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RASL12Q9NYN1 266 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 UBBP0CG47 229 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 IL2RGP31785 369 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SCN1BQ07699 218 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TAF9Q16594 264 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 Q8IYB0 196 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TIMD4Q96H15 378 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 Q96M66 194 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GAFA1Q96PS6 74 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 FOXC2Q99958 501 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CTSZQ9UBR2 303 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GHRLQ9UBU3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF222Q9UK12 451 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 A0A096LNT2 108 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM82A0PJX8 343 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 NDUFS8O00217 210 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SOCS1O15524 211 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ADAM20O43506 726 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 HAND1O96004 215 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GTF2F2P13984 249 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GABRR1P24046 479 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 PRDX2P32119 198 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CAPZA1P52907 286 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 DSCR9P59020 149 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 COL10A1Q03692 680 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 IKZF1Q13422 519 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 GPR176Q14439 515 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF146Q15072 292 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SHEQ5VZ18 495 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 BRICD5Q6PL45 260 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 DTX3Q8N9I9 347 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RHOFQ9HBH0 211 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 BATF3Q9NR55 127 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RAB22AQ9UL26 194 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ITPR3Q14573 2671 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RNF223E7ERA6 249 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SIRPB1O00241 398 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 HSPB6O14558 160 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 CTDSP2O14595 271 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 SH2D1BO14796 132 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 TMPRSS2O15393 492 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 PSPNO60542 156 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 HPGDSO60760 199 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 FSTL3O95633 263 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 OR2H2O95918 312 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 WNT2P09544 360 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF44P15621 663 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 VEGFCP49767 419 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 LMO4P61968 165 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB5-211ENST00000608107 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.8 ms