RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RASL12Q9NYN1 266 aa8.73□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIRPB1O00241 398 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC17A2O00624 439 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC22A1O15245 554 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMPRSS2O15393 492 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CYB5AP00167 134 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VSIG8P0DPA2 414 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HTR2CP28335 458 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERPINB10P48595 397 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MTNR1BP49286 362 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCN2P80188 198 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 QRFPP83859 136 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COL10A1Q03692 680 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB11BQ15907 218 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BIVMQ86UB2 503 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDH26Q8IXH8 852 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPICQ8N5J4 248 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDNFQ8TB73 568 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.72□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0A6YYD4 124 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFITM5A6NNB3 132 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DVL1O14640 695 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDCD5O14737 125 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MPIG6BO95866 241 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HAND1O96004 215 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PAHP00439 452 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KNG1P01042 644 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD99P14209 185 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EFNB2P52799 333 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UNC119Q13432 240 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPCS2Q15005 226 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TAF9Q16594 264 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ELP2Q6IA86 826 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8NFD4 153 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 S100A13Q99584 98 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHST6Q9GZX3 395 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MMP26Q9NRE1 261 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ING3Q9NXR8 418 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIOXQ9UGB7 285 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DPPA5A6NC42 116 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NOTOA8MTQ0 251 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C22orf46C9J442 243 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPB6O14558 160 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEGS1O15121 323 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIGLEC5O15389 551 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSPNO60542 156 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF737O75373 536 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GABARAPO95166 117 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FSTL3O95633 263 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LY6G6DO95868 133 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2H2O95918 312 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PITPNBP48739 271 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAPZA1P52907 286 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FGF12P61328 243 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BLMHQ13867 455 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IDNKQ5T6J7 187 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TPRA1Q86W33 373 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OSR2Q8N2R0 312 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DTX3Q8N9I9 347 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms