RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SEH1LQ96EE3 360 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF488Q96MN9 340 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTT2BP0CG30 244 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 PTHLHP12272 177 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT3P21217 361 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 AP3S2P59780 193 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAH1Q13510 395 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGIRRQ6IA17 410 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8TCH9 128 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ST8SIA4Q92187 359 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIOCA2RUB1 952 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NNC1 897 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 HS3ST1O14792 307 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ORC5O43913 435 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GDNFP39905 211 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF146Q15072 292 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF826PQ6ZT77 177 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM90A1Q86YD7 464 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM5Q8N4H5 51 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK7Q9Y2U2 307 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SRRM5B3KS81 715 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 LANCL1O43813 399 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GLAP06280 429 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GLRA1P23415 457 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PPOXP50336 477 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG2P59768 71 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GCM1Q9NP62 436 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 DECR2Q9NUI1 292 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GLS2Q9UI32 602 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF224P0DH78 156 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX5P45973 191 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM21Q3B7S5 101 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP6Q5VW22 663 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 MOGAT3Q86VF5 341 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 BATF2Q8N1L9 274 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 POC5Q8NA72 575 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11L1Q8NGX0 322 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC29Q8WV35 223 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 HPS1Q92902 700 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLN4Q9NTU7 201 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK11Q9UBX7 282 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D24Q9ULP9 559 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 DYRK1AQ13627 763 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ACP7Q6ZNF0 438 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 MINDY2Q8NBR6 621 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SAP30LQ9HAJ7 183 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 NPTNQ9Y639 398 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD6Q8TD26 2715 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PTTG1O95997 202 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CSF1P09603 554 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 IKZF1Q13422 519 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ARFRP1Q13795 201 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 NKAPLQ5M9Q1 402 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf201Q7Z4U5 140 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF7Q9UBF6 113 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNL4K9M1U5 179 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 KNG1P01042 644 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 LHBP01229 141 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL8P80075 99 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCA2AQ02747 115 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 COX4I2Q96KJ9 171 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 FLNCQ14315 2725 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC18AA5D8T8 446 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPXA8MT69 81 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D1BO14796 132 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRNQ5BIV9 151 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ATAD3CQ5T2N8 411 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC18BQ6UXF7 455 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 DTX2Q86UW9 622 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC18CQ8NCF0 446 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 IL36RNQ9UBH0 155 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM221AA4D161 298 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G10O15496 165 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF2P14316 349 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RCVRNP35243 200 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SNU13P55769 128 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 MZT2BQ6NZ67 158 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 GCSAMQ8N6F7 178 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CHPT1Q8WUD6 406 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa26.15■■□□□ 1.78
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