RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATRX	P46100	2492 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	LYZL6	O75951	148 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	IL32	P24001	234 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	OPRM1	P35372	400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	HAAO	P46952	286 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	GMFB	P60983	142 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCTD9	Q7L273	389 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	PHB2	Q99623	299 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	OPA3	Q9H6K4	179 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	KALRN	O60229	2985 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM221A	A4D161	298 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	HLA-G	P17693	338 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	GLRA1	P23415	457 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q8NFD4	153 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	EXTL1	Q92935	676 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	WNT2B	Q93097	391 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494		F8VVB4	439 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494		F8VWA3	439 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	PDCD6	O75340	191 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SCO1	O75880	301 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SFT2D2	O95562	160 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	FCGR3A	P08637	254 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	DTYMK	P23919	212 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	CALCR	P30988	508 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	GABRA6	Q16445	453 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	TBR1	Q16650	682 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	CD8A	P01732	235 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	FUT3	P21217	361 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	FOXF2	Q12947	444 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6ZT83	130 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	SYNGR1	O43759	233 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	NMB	P08949	121 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNRF1-208	ENST00000568494	PGAM2	P15259	253 aa		11.38	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms