RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-208	ENST00000563830	NES	P48681	1621 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-208	ENST00000563830	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	IGLL5	B9A064	214 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RGS5	O15539	181 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	NRAS	P01111	189 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	HRAS	P01112	189 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	KRAS	P01116	189 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	IMPA1	P29218	277 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SPAM1	P38567	509 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RANBP1	P43487	201 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	C1QTNF8	P60827	252 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SSX1	Q16384	188 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830		Q3ZCU0	254 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830		Q499Y3	187 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TTMP	Q5BVD1	217 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	NELFB	Q8WX92	580 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TVP23C	Q96ET8	276 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	DDIT4	Q9NX09	232 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	NID2	Q14112	1375 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RAB19	A4D1S5	217 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TVP23A	A6NH52	213 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	LEUTX	A8MZ59	168 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CXorf1	O96002	111 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	RLN2	P04090	185 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GIMD1	P0DJR0	217 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CCL2	P13500	99 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CD9	P21926	228 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PSMB9	P28065	219 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	STX4	Q12846	297 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GUSBP1	Q15486	140 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GLYAT	Q6IB77	296 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TCF24	Q7RTU0	167 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	BIRC8	Q96P09	236 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SRR	Q9GZT4	340 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ASB7	Q9H672	318 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PGP	A6NDG6	321 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	VGLL3	A8MV65	326 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	C4orf51	C9J302	202 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GYG2	O15488	501 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	YKT6	O15498	198 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CST4	P01036	141 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	IGKV1D-16	P01601	117 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	IGHG2	P01859	326 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PRTN3	P24158	256 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GCLM	P48507	274 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	BAX	Q07812	192 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	C6orf183	Q5T699	404 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830		Q6ZQT7	251 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830		K7EM74	188 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SC5D	O75845	299 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	IL12B	P29460	328 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TGFBR1	P36897	503 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	CCL23	P55773	120 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ATP5J2	P56134	94 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	TNNC1	P63316	161 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	C2orf80	Q0P641	193 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	HBM	Q6B0K9	141 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-208	ENST00000563830	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2

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