RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.38□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RAB22AQ9UL26 194 aa7.38□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.38□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FLNCQ14315 2725 aa7.38□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 H3BMQ9 156 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TMPRSS2O15393 492 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NDUFB3O43676 98 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 HAND1O96004 215 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ZNF44P15621 663 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 MGMTP16455 207 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 DUSP1P28562 367 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SCAND1P57086 179 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 IL13RA2Q14627 380 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SPCS2Q15005 226 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ZNF146Q15072 292 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TAF9Q16594 264 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 STUMQ69YW2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR10K2Q6IF99 312 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 MZT2AQ6P582 158 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ZNF561Q8N587 486 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NDNFQ8TB73 568 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM46BQ96A09 425 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 PTX4Q96A99 478 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RAB39BQ96DA2 213 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR8B2Q96RD0 313 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PP11 408 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 A6NHS1 94 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 AMY2BP19961 511 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RAB6AP20340 208 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LMO1P25800 156 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 PITPNBP48739 271 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 IL13RA1P78552 427 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 QRFPP83859 136 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 COL10A1Q03692 680 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 IKZF1Q13422 519 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 PDCD1Q15116 288 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 MPV17LQ2QL34 196 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LCE2CQ5TA81 110 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 LINC00596Q86U02 117 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 CD177Q8N6Q3 437 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 CHST4Q8NCG5 386 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TMEM104Q8NE00 496 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 PHF21AQ96BD5 680 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SDSLQ96GA7 329 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SNX22Q96L94 193 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 SPATA2Q9UM82 520 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 ETV7Q9Y603 341 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 A0A0B4J203 849 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FUOMA2VDF0 154 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-210ENST00000560890 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms