RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 DOC2BQ14184 412 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 CDK5R1Q15078 307 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TCF23Q7RTU1 214 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SETD9Q8NE22 299 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GGHQ92820 318 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 AJUBAQ96IF1 538 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 CHST6Q9GZX3 395 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 DHDHQ9UQ10 334 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SULT1B1O43704 296 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 PSPNO60542 156 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 CYB5AP00167 134 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 HCKP08631 526 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 EDDM3BP56851 147 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZP1P60852 638 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ST3GAL4Q11206 333 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 FOXL1Q12952 345 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 EDDM3AQ14507 147 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 KISS1Q15726 138 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TAF9Q16594 264 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF529Q6P280 563 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 Q8IYB0 196 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR8H2Q8N162 312 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM86BQ8N661 226 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 NRG4Q8WWG1 115 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ORAI1Q96D31 301 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM80Q96HE8 168 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 NEK6Q9HC98 313 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 HMG20AQ9NP66 347 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 IRGMA1A4Y4 181 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SIRPB1O00241 398 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OGG1O15527 345 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GPR137BO60478 399 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 KDM4BO94953 1096 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 FBP1P09467 338 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM225BP0DP42 221 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 MYL12AP19105 171 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GABRR1P24046 479 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 COX7A1P24310 79 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR3A1P47881 315 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 BMXP51813 675 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF146Q15072 292 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GRK1Q15835 563 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 CCDC58Q4VC31 144 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GPR148Q8TDV2 347 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 TFAP2CQ92754 450 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SNX22Q96L94 193 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 C1RLQ9NZP8 487 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ERICH4A6NGS2 130 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 C17orf98A8MV24 154 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 GABRPO00591 440 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ALX3O95076 343 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OR2H2O95918 312 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF728P0DKX0 622 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 RAB3AP20336 220 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC34A1Q06495 639 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 SCN1BQ07699 218 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms